Kontrola sa vykonáva formou miestneho zisťovania, ktoré upravuje daňový poriadok, čiže zákon č. 563/2009 Z. z. o správe daní (daňový poriadok) a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov alebo zákon č. 35/2019 Z. z. o finančnej správe a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov. V oprávnených dôvodoch sú orgány finančnej správy oprávnené v rozsahu 30 dní vykonať u predávajúceho nákup tovaru alebo prijať službu aj opakovane, a to bez oficiálneho miestneho zisťovania a teda bez povinnosti spísať zápisnicu o miestnom zisťovaní. To znamená, že predávajúci v týchto prípadoch ani nebude vedieť, že išlo o kontrolný nákup.
O každom takomto kontrolnom nákupe je zamestnanec finančnej správy povinný spísať úradný záznam a po vykonaní posledného kontrolného nákupu sa musí predávajúcemu preukázať služobným preukazom a spísať zápisnicu z miestneho zisťovania, v ktorej uvedie informácie o vykonaných kontrolných nákupoch. Orgány finančnej správy by mali čo najväčšiu možnosť kontroly dodržiavania ustanovení týkajúcich sa pokladnice eKasa. Z týchto dôvodov sa ustanovili prostriedky, ktoré je možné pri tejto kontrole využiť. Všetky doklady majú úlohu dôkazov, ktoré sa predkladajú orgánom finančnej správy. Hľadí sa na ne ako keby boli predložené v rámci miestneho zisťovania alebo daňovej kontroly, pri uplatnení nielen daňového poriadku alebo zákona o účtovníctve.
